生物有机肥实验室，顾名思义就是用来做生物有机肥实验的场所。
生物有机肥实验室的建立主要是为了满足农业生产的需要，提高农作物的产量和品质，同时降低农药、化肥的使用量，减少环境污染。
生物有机肥实验室一般由以下几部分组成：土壤化验室、微生物培养室、肥料加工车间、包装车间及仓库等设施构成。
1、土壤化验室：
用于检测土壤中各种营养元素的含量以及酸碱度等理化性质的变化情况；测定土壤中有机质的含量和腐殖质含量；分析作物生长过程中所需的营养元素种类及数量等；对土壤中的有害成分进行监测与鉴定。
2、微生物培养室：
用于微生物的种类和特性；分离筛选有益菌株并制成菌种液供生产使用；制备不同种类的发酵剂或接种剂供生产时使用等等。常见的微生物有细菌（包括霉菌）、放线菌（包括真菌）以及病毒等类型，其中又以细菌为主。
3、肥料加工车间：
用于将原料粉碎后加入一定比例的水混合均匀制成液体或固体颗粒状的有机肥成品或者液体肥料成品（如液态复合肥料）。根据不同的用途可以添加一些微量元素或者氨基酸等其他成分以提高其养分含量和使用效果。（例如：氮磷钾三元素复合配方）。
4、包装车间：
将制成的肥料成品装入袋中或瓶中密封包装即可出售给用户使用。（如液态复合肥料）（注：有些产品还需要通过干燥处理才能储存。）常见的设备主要有粉碎机、搅拌器、制粒机、烘干机等设备组成。（注：有的设备是专门针对某类产品的特殊设计）。
5、仓库：
存放制作好的各类产品以便于运输和销售使用。（如液态复合肥料）。常见的材料主要有水泥地面（防潮）、砖混地面（防水）、钢结构屋顶（防雨雪风沙腐蚀），此外还有通风柜、货架、叉车、吊车等等。
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